Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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