Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRN3Q13033 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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