Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPN13Q12923 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPN13Q12923 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPN13Q12923 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPN13Q12923 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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