Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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