Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFEMP1Q12805 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFEMP1Q12805 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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