Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFCP2Q12800 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFCP2Q12800 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms