Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms