Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPSF1Q10570 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CPSF1Q10570 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms