Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms