Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSRP1Q08945 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSRP1Q08945 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms