Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCN1BQ07699 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms