Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms