Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNG1Q06432 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms