Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN11Q06124 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms