Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms