Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN1Q04323 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN1Q04323 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms