Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms