Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms