Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPEQ02224 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPEQ02224 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms