Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPCQ01831 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPCQ01831 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
XPCQ01831 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
XPCQ01831 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPCQ01831 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPCQ01831 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPCQ01831 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms