Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTUD4Q01804 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms