Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms