Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms