Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2BQ00403 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2BQ00403 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2BQ00403 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms