Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD3P84022 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms