Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
IRX1P78414 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRX1P78414 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRX1P78414 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRX1P78414 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRX1P78414 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRX1P78414 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRX1P78414 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRX1P78414 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms