Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms