Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOBP62745 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOBP62745 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOBP62745 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOBP62745 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOBP62745 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms