Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms