Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK11-1P61568 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms