Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ABCE1P61221 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ABCE1P61221 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ABCE1P61221 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ABCE1P61221 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms