Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms