Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AQP4P55087 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AQP4P55087 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AQP4P55087 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms