Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP98P52948 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP98P52948 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP98P52948 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP98P52948 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP98P52948 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP98P52948 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP98P52948 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP98P52948 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP98P52948 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP98P52948 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP98P52948 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP98P52948 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP98P52948 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP98P52948 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP98P52948 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP98P52948 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP98P52948 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP98P52948 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms