Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms