Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC3P51654 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GPC3P51654 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC3P51654 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC3P51654 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC3P51654 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC3P51654 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms