Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAMP50895 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAMP50895 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAMP50895 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAMP50895 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms