Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERFP50548 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERFP50548 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERFP50548 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERFP50548 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms