Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCLCP48506 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCLCP48506 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCLCP48506 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCLCP48506 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GCLCP48506 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GCLCP48506 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GCLCP48506 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCLCP48506 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms