Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PIK3CBP42338 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms