Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms