Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGCXP38435 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GGCXP38435 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GGCXP38435 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGCXP38435 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGCXP38435 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GGCXP38435 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms