Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTBRP36941 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTBRP36941 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTBRP36941 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTBRP36941 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms