Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB2P35606 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB2P35606 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB2P35606 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB2P35606 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB2P35606 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB2P35606 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB2P35606 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB2P35606 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB2P35606 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB2P35606 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms