Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN4AP35499 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms