Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC4P35249 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC4P35249 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC4P35249 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC4P35249 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC4P35249 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms