Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPC1P35052 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GPC1P35052 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GPC1P35052 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC1P35052 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC1P35052 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms