Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRS3P32247 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms