Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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CASQ1P31415 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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CASQ1P31415 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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CASQ1P31415 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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CASQ1P31415 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CASQ1P31415 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASQ1P31415 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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