Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms